Nationaal?
Prins Hendrik wilde graag dat de club nationaal zou zijn. Maar al snel ontstond er gekrakeel tussen de Rotterdammers en Amsterdammers. Veel Amsterdammers verlieten de club in 1847 en richtten in hun eigen stad de Nederlandsche Zeil- en Roeivereniging op.
Opheffing
De financiƫle nood werd groot, prins Hendrik sprong telkens bij.
Het gebouw werd ondanks zijn ruime geldelijke steun een financieel blok aan het been. Het
werd op 15 februari 1874 grotendeels opengesteld voor het publiek als Maritiem Museum Prins Hendrik.
De naamgever overleed in 1879.
De vereniging werd op 5 mei 1880 opgeheven. De gemeente kocht het gebouw, het Maritiem Museum Prins Hendrik mocht er kosteloos gebruik van maken.
De in 1851 opgerichte Roei- en Zeilvereniging De Maas nam al het materiaal van de Yachtclub over.